Hola compañero:
A mi me encantan los motores honda, no soy un experto pero tengo el manual de reparaciones, de acuerdo a lo que relatas en el manual apunta a que:
Le hagas una afinación mayor a tu carro, limpiale los inyectores, checa que tu bomba de gasolina este sirviendo bien ya que aveces pueden no dar suficiente combustible al sistema de inyectores, que revisen que no haya fugas en la válvula EGR y que chequen bien el sistema de admisión que no tenga alguna fuga en un lugar.
Si después de eso no se arregla entonces puede ser que: El gasket de la cabeza tenga fugas, que la banda del tiempo o las mismas poleas ya no estén bien, que el árbol de levas ya no este en optimas condiciones.
Espero y la información del manual te sirva de alguna ayuda. Te recomiendo ir con tu mecánico de confianza y que se ayude de esta información y sumado a su experiencia podrá resolverte tu problema!
Suerte y no olvides en regresar y contarnos como te fue